Не первый раз слышу про проблему шрифтов Оперы, но сам с ней не сталкивался лет пять, а до того она решалась негодными сейчас методами, она тогда на Qt ещё была.
У меня в Gentoo и Ubuntu сглаживает отлично. То есть совершенно системно:
Была в KDE4 под Ubuntu недавно обратная проблема, внутри Оперы шрифты отличные, а системное меню (как и всё в KDE) имели паршивый рендеринг. Но это настройки KDE-шные. Хотя намекает на то, что Опера, вероятно, в KDE использует настройки не KDE, а того же Gnome.
Попробуй с этого направления рассмотреть

Я KDE не пользуюсь с 2004-го, недели, потраченной на него в начале этого года не хватило, чтобы я смог его принять, к счастью, разобрался, как Gnome3 привести к виду Gnome2