Компиляторы поддерживающие стандарт C99.

Неожиданно для себя обнаружил, что Visual C стандарта С99 не поддерживает.

Есть ли какая-нибудь визуальная среда програмирования на С, где бы этот стандарт поддерживался бы?

Ну, вот, например, раскладка по поддержке C99 у GCC: Status of C99 features in GCC - GNU Project - Free Software Foundation (FSF)

А визуальной средой к нему можно Eclipse SDK подключить.

А какой VC у тебя?